วันที่ 1 ก.พ. 2555 เวลา 13.00น. ที่โรงแรมโกลเด้นทิวลิป ซอฟเฟอริน มีการประชุมเตรียมความพร้อมและการจับสลากประกบคู่ ฟุตบอลเอไอเอสลีกภูมิภาคดิวิชั่น 2 ฤดูกาล 2012 โดยมีดร.สมบัติ คุรุพันธ์ ผู้ช่วยรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการท่องเที่ยวและกีฬา ในฐานะประธานคณะกรรมการอำนวยการจัดการแข่งขันศึกฟุตบอลลีกภูมิภาคเป็นประธานในพิธี ร่วมกับนายสกล วรรณพงษ์ รองผู้ว่าการกีฬาแห่งประเทศไทย และนายวิมล กาญจนะ ในฐานะประธานคณะกรรมการจัดการแข่งขัน

  สำหรับฤดูกาล2012  มีทีมเข้าร่วมการแข่งขันทั้งสิ้น 81 ทีม แบ่งเป็น 5 ภูมิภาค คือ โซนภาคเหนือ 18 ทีม, ภาคตะวันออกเฉียงเหนือ 16 ทีม, ภาคกลาง และภาคตะวันออก 18 ทีม, กรุงเทพและปริมณฑล 18 ทีม และภาคใต้ 11 ทีม โดยจะคัดเลือกอันดับ 1-2 ของโซนภาคเหนือ, ภาคตะวันออกเฉียงเหนือ, ภาคกลาง และภาคตะวันออก, กรุงเทพ และปริมณฑล และอันดับ 1 ของภาคใต้ รวมถึงอันดับ 3 ที่ทำคะแนนดีที่สุด 2 อันดับแรก ของโซนภาคกลาง และโซนกรุงเทพและปริมณฑล จะเข้ารอบแชมเปี้ยนส์ลีกโดยอัตโนมัติ ส่วนอันดับ 2 ของภาคใต้ ต้องไปเตะเพลย์ออฟกับทีมอันดับ 3 ที่ได้คะแนนน้อยที่สุดจากโซนภาคเหนือ, ภาคกลาง และกรุงเทพ เพื่อคว้าสิทธิเข้ารอบนี้ต่อไป

ผลการจับฉลาก 

คู่เปิดสนาม 14 กุมภาพันธ์ 2555  
ร้อยเอ็ด ยูไนเต็ด พบ ยโสธร ยูไนเต็ด ที่สนามกีฬากลางจังหวัดร้อยเอ็ด เวลา 18.00น. ถ่ายทอดสดช่อง 11

ส่วนคู่อื่นๆในแต่ละโซนจะเริ่มแข่งขันในวันที่ 18-19 กุมภาพันธ์โดยมีโปรแกรมการแข่งขันดังนี้

โซนภาคตะวันออกเฉียงเหนือ

18 กุมภาพันธ์ 2555
อุดรธานี พบ นครพนม
ชัยภูมิ ยูไนเต็ด พบ กาฬสินธุ์ 
หนองคาย พบ สกลนคร

19 กุมภาพันธ์ 2555
มหาสารคาม ยูไนเต็ด พบ เลย ซิตี้
ศรีสะเกษ ยูไนเต็ด พบ มุกดาหาร ซิตี้
หนองบัวลำภู พบ สุรินทร์ เอฟซี
อุบล ไทเกอร์ พบ อำนาจเจริญ ทาวน์